Etenkin saksankielisellä alueella vaaleaa Chardonnay-lajiketta kutsuttiin nimellä Pinot Chardonnay, joka puolestaan kuuluisan köynnösluokittajan Galet´n mielestä oli selvästi virheellinen nimi, koska Chardonnaylla ei hänen mielestään ollut mitään tekemistä eri Pinot-lajikkeiden kanssa.

Kuitenkin vuoden 1998 Chardonnay-lajikkeen DNA-analyysissä päädyttiin tulokseen, että Chardonnay on nykyisin käytännössä kadonneen Pohjois-Ranskan volyymiköynnöksen GOUAIS BLANCin sekä jonkin Pinot-perheen (luonnollinen) risteytymä. Todennäköisin Pinot-perheen edustaja Chardonnayssa on näiden kahden lajikkeen levinneisyyden perusteella Pinot Noir. Muita nykypäivänä viljeltyjä Gouais Blancin ja Pinot-lajikkeiden risteytyksiä ovat tumma Gamay sekä vaaleat Auxerrois, Aligoté ja Muscadet. Chardonnay on monesti laatuvalkoviinin synonyymi ja Cabernet Sauvignon laatupunaviinin ja kummatkin ovat luonnon sattumanvaraisia risteytyksiä, jotka tosin ranskalaiset ovat pelastaneet jälkipolville.